第一，口腔疾病，口腔疾病是导致口臭的最主要因素，特别是牙齿的病变，如牙龈炎，牙周炎，蛀牙，亚洲脓肿等等都会，另外，口腔溃疡，口腔炎，口腔癌等也会导致口臭，主要原因是细菌的寄生与感染，特别是某些厌氧菌发酵产生硫化氢、吲哚和氨类。
第二，消化道疾病，很多消化道疾病也会引起口臭，常见的是消化性溃疡，反流性食管炎，胃炎，胃癌等等，主要因素是由于幽门螺杆菌感染，这是一种寄生在胃内的细菌，会刺激胃酸分泌，同时发酵释放多种富有臭味的气体。
第三，全身性疾病，很多全身性疾病也可以引起口臭，如糖尿病酮症酸中毒，尿毒症，白血病，维生素缺乏，重金属中毒都有可能。
如果检查的时候排除了口腔疾病，那么就要警惕是不是感染了幽门螺杆菌，出现了胃部的不适，研究发现，幽门螺杆菌感染是除了口腔疾病外导致口臭的第二大因素，幽门螺杆菌不仅会导致胃部疾病，还可能导致口腔疾病。