关于咖啡致癌的传说，主要是来自其含有的丙烯酰胺，但这种物质并非咖啡独有，而且人们摄入的丙烯酰胺主要也不是来自咖啡。
2016年，国际癌症研究机构（IARC）对现有研究进行综合分析后认为，并没有足够的证据显示喝咖啡会增加人类癌症的风险。
同时有部分证据表明，咖啡能降低某些癌症的风险，例如乳腺癌、子宫内膜癌及肝癌，虽然不能说咖啡可以抗癌，但至少说它致癌是有点冤枉。
有的消费者对咖啡因敏感，喝了之后会出现心跳加速、恶心、头晕等不适感，类似“茶醉”的现象，因此怀疑可能会诱发心脏病。
美国心脏病协会、欧洲心脏病学会、澳大利亚国家卫生和医学研究协会等机构均认为，健康成年人适量饮用咖啡（每天1-2杯）不会增加患心脏病和心血管疾病的风险。
但需要提示的是，虽然并没有官方结论说有心脏病的人不能喝咖啡，但大家还是需要根据自身情况调整饮用频次及饮用量。
中国营养学会的《食物与健康-科学证据共识》指出，适量饮用咖啡（每天3-4杯）可能降低2型糖尿病风险。
国际糖尿病联盟、美国糖尿病协会等机构认为，糖尿病患者可以适量饮用咖啡，纯咖啡可以作为健康膳食的一部分。
我觉得可能的解释是，喝咖啡的人喝其他含糖饮料的量就会减少，因此喝不加糖的美式咖啡应该更健康一些。
对于骨质疏松患者来说，除适当控制含咖啡因饮料的摄入量，还应当保持膳食平衡以确保足量的钙和维生素摄入，辅以适度的运动和阳光照射。