首先，最重要的一点就是洗净煮熟。螃蟹通常以动物尸体或腐殖质为食，其体表、鳃及胃肠道中布满了各类细菌和污泥，生食螃蟹易导致感染性中毒，引发肠道发炎、水肿等，因此食用时一定要煮透蒸熟。其次是忌食死蟹，螃蟹死后，其体内的细菌会迅速繁殖并扩散到蟹肉中去，食用死蟹同样易引起食物中毒，造成肠道感染性疾病。
吃不完的螃蟹也要小心存放，熟蟹极易被细菌侵入而污染，最好时候现烧现吃。若是一次吃不完，剩下的也要保存在干净、阴凉通风的地方，再食用时必须回锅蒸熟蒸透。
眼下正是吃螃蟹的季节，本身肠道敏感的人吃蟹，或者一次性食用螃蟹过多过量，都容易诱发腹泻、肠炎等肠道疾病。9月7日，在肠道健康中国行南京站的公益讲座上，北京协和医院基本外科主任医师林国乐教授告诉记者，肠道疾病不重视，小问题有可能酿成大患。
林国乐教授特别强调，螃蟹虽美味，还应注意适量。大家平时也要加强肠道日常调理，最直接的办法就是补充有益菌，比如可以嚼一嚼乳酸菌素片，它可以选择性杀死肠道的致病菌，保护促进有益菌的生长，维持肠道菌群的平衡。