低危型 HPV一般与尖锐湿疣或低级别鳞状上皮内病变相关，检测的临床价值尚不明确，无法起到宫颈癌筛查作用。
据统计，80%的妇女一生中都可能感染HPV，其中大多数是一过性感染，能够被自身免疫系统清除，并不产生病变。也就是说，感染不等于病变。
一项研究发现，组织学检查正常、CIN1、CIN2 及以上的RLU/CO 中位数分别是42.68，146.45和156.43，且3组的可信区间广泛重叠，故得出RLU/CO值与CIN的存在显著相关，但与病变严重程度关系不大的结论。
需要注意的是，该研究中的RLU/CO值是被检测者HPV病毒载量的总和，也就是说如果感染多种亚型，RLU/CO值代表其所有阳性亚型病毒载量总和。而对于仅感染同一种HPV亚型（如HPV16）的妇女而言，测定值越高，发生CIN2+的风险有所增加（HR：1.34，95%CI1.10～1.64）。
临床上 HPV检测产品众多。目前，共有4 种HPV 检测技术通过美国 FDA 认证，用于宫颈癌初筛：
但即使都是 FDA认证的 HPV检测技术，检测的目的基因片段、方法和亚型也不尽相同，结果也可能不同。
近年来，多项大型临床研究表明，Aptima检测HPV的敏感度与HC2、Cobas相当，而特异度和阳性预测值显著提高。
其中，两个独立研究小组分别对细胞学结果异常，进行HPV分流时将Aptima和HC2的检查结果进行比较，结果显示，Aptima相比HC2减少了21%～23%的阴道镜转诊率。
这意味着，在保证宫颈病变检出率不变的前提下，Aptima方法的假阳性率更低，从而减少不必要的阴道镜转诊和宫颈活检率。
究其原因，一方面是特殊类型宫颈癌，如宫颈微偏腺癌、内膜样癌等可能与 HPV感染无关（这类宫颈癌蜡块组织中 HPV检测阳性率仅为 0～27.3%）。
另一方面，任何一种 HPV检测方法都存在一定假阴性率，现有筛查方法尚无法达到100%的敏感度和特异度。
这一数据的原文来源于美国癌症协会、美国阴道镜和宫颈病理协会以及美国临床病理协会于 2012年联合推出的宫颈癌预防和早期筛查指南。（依据之一为 2007 年发表于 J Infect Dis 题为《细胞学 ASC- US 或宫颈低度鳞状上皮内病变（LSIL）妇女 2年 HPV持续感染的前瞻性研究》，依据之二是 2008年发表于 JNatl Cancer Inst题为《HPV的快速清除及持续性感染临床焦点的应用》。）
文献中，2年91%的清除率是限定在年龄＜30岁的妇女中，≥30 岁妇女中79%～80%是一过性感染。
这说明，HPV感染自然转阴率与年龄相关。当年轻妇女无法清除HPV时进入持续感染阶段，持续感染状态的妇女随着年龄增大比例增加，这是对年龄较大或性生活时间较长的妇女进行HPV检测更有意义的原因所在。
临床上,应避免对＜25 岁的女性进行HPV初筛，应在细胞学 ASC-US 时进行 HPV 分流。
总之，对于＜30岁的女性（尤其＜25岁），不宜轻易进行 HPV检测，避免 HPV一过性感染导致不必要的心理负担和家庭矛盾。